Es autor y coautor de varias publicaciones en revistas científicas especializadas y capítulos en libros, también ha escrito artículos en revistas de divulgación científica. Ha participado en importantes proyectos académicos e impartido conferencias en más de 70 reuniones nacionales e internacionales sobre tópicos de la especialidad en Ingeniería Agrícola y de Biosistemas, tema en el cual realizó sus estudios de posdoctorado en: The Department of Agricultural and Biosystems Engineering de la Universidad del Estado de North Dakota. Egresó de la Licenciatura en Química y obtuvo el grado de Maestro en Ciencias con especialidad en Almacenamiento y Procesamiento de Granos en la Universidad de Sonora. Obtuvo el grado de Doctor en Ciencias en Biotecnología de Plantas en Cinvestav-IPN. Cabe señalar que obtuvo la distinción del Premio Nacional en Ciencia y Tecnología de Alimentos, 1987, otorgado por Coca-Cola-Conacyt; las distinciones del Premio de Investigación en Salud, 1994 y 2008 otorgado por la Secretaría de Salud y el Gobierno de Sonora.
En 1995 fue nombrado Director de División de Ciencias Biológicas y de la Salud en la Universidad de Sonora donde actualmente labora como Profesor-Investigador Titular C, en el Departamento de Investigación y Posgrado en Alimentos. La Organización de los Estados Americanos le otorgó una beca posdoctoral. En el periodo 1997-1999 fue Profesor Visitante en la Universidad del Estado de North Dakota.
Obtuvo los diplomados: Programa de Liderazgo en Energías Renovables. Harvard University,T.C. Chan/SENER/IntrustGlobal, Sede Zona Norte, 2015. Programa Internacional en Innovación y Sustentabilidad en Sonora. Harvard University, T.C. Chan/ School of Public Health, 2018.
Es fundador y Presidente del Comité Organizador de la 1er Reunión Internacional Sobre Energías Alternativas Renovables del Noroeste de México, Junio 2016; la 3ra Reunión Internacional Sobre Políticas con Impacto Social para las Ciudades Verdes en el Futuro de México y el 1er Foro Nacional Sobre el Corredor Biológico de Hermosillo. Octubre, 2020. Universidad de Sonora, Hermosillo. E- mail: vargaslopez.juan@gmail.com